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Rev 6132 Rev 12170
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2 
textarea="data file atom scriptinput scriptoutput"
 2 
textarea="data file atom scriptinput scriptoutput"
3 
 
 3 
 
4 
:Sélectionner certains atomes d'une molécule
 4 
:Seleccionar alguns àtoms d'una molècula
5 
 
 5 
 
6 
On présente une molécule dans l'applet Jmol et on demande de sélectionner
6 
Es presenta una molècula a la miniaplicació de Jmol i es demana seleccionar
7 
certains atomes
 7 
alguns àtoms
8 
<p>
 8 
<p>
9 
Pour construire un exercice avec ce modèle, il suffit de donner le fichier
9 
Per construir un exercici amb aquest model, simplement s'ha de donar el fitxer
10 
de structure et d'indiquer les atomes devant être sélectionnés.
 10 
d'estructura i indicar els àtoms a seleccionar.
11 
 
 11 
 
12 
<p>
 12 
<p>
13 
Auteurs du modèle : Yves Noël et Bernadette Perrin-Riou <yves.noel@upmc.fr>
 13 
Autors del model: Yves Noël et Bernadette Perrin-Riou <yves.noel@upmc.fr>
14 
 
 14 
 
15 
:%%%%%%%%%%%%%%%%%      ATTENTION      %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
 15 
:%%%%%%%%%%%%%%%%%      ATTENTION      %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
16 
 
 16 
 
17 
Enlevez l'en-tête ci-dessus si vous détruisez les balises pour le modèle !
 17 
Enlevez l'en-tête ci-dessus si vous détruisez les balises pour le modèle !
18 
(Ce sont les lignes qui commencent par un ':'.)
 18 
(Ce sont les lignes qui commencent par un ':'.)
19 
Sinon l'exercice risque de ne pas pouvoir repasser sous Createxo.
 19 
Sinon l'exercice risque de ne pas pouvoir repasser sous Createxo.
20 
 
 20 
 
21 
:%%%%%%%% Paramètres d'exemples à redéfinir %%%%%%%%%%%%%%%%%
 21 
:%%%%%%%% Paramètres d'exemples à redéfinir %%%%%%%%%%%%%%%%%
22 
 
 22 
 
23 
:\title{Sélectionner dans l'espace}
 23 
:\title{Seleccionar a l'espai}
24 
:\author{Yves, Noël ; Bernadette, Perrin-Riou}
 24 
:\author{Yves, Noël ; Bernadette, Perrin-Riou}
25 
:\email{yves.noel@upmc.fr}
 25 
:\email{yves.noel@upmc.fr}
26 
:\credits{}
 26 
:\credits{}
27 
 
 27 
 
28 
:Fichier MDMol
 28 
:Fitxer MDMol
29 
\text{file=xxx
 29 
\text{file=xxx
30 
Jmol version 11.7.31  2009-03-28 16:42
 30 
Jmol version 11.7.31  2009-03-28 16:42
31 
EXTRACT: visible
 31 
EXTRACT: visible
32 
 24 25  0  0  0
 32 
 24 25  0  0  0
33 
 -3.380413 -1.127236 0.5733036 H
33 
 -3.380413 -1.127236 0.5733036 H
34 
 0.9668296 -1.073742 -0.819822 N
34 
 0.9668296 -1.073742 -0.819822 N
35 
 0.0567293 0.8527195 0.3923156 C
35 
 0.0567293 0.8527195 0.3923156 C
36 
 -1.375174 -1.021224 -0.057055 N
36 
 -1.375174 -1.021224 -0.057055 N
37 
 -1.261501 0.2590713 0.5234135 C
37 
 -1.261501 0.2590713 0.5234135 C
38 
 -0.306833 -1.683633 -0.716934 C
38 
 -0.306833 -1.683633 -0.716934 C
39 
 1.1394234 0.1874122 -0.27009  C
39 
 1.1394234 0.1874122 -0.27009  C
40 
 0.5602627 2.0839095 0.8251589 N
40 
 0.5602627 2.0839095 0.8251589 N
41 
 -0.492679 -2.818055 -1.209473 O
41 
 -0.492679 -2.818055 -1.209473 O
42 
 -2.632807 -1.730396 -0.006095 C
42 
 -2.632807 -1.730396 -0.006095 C
43 
 -2.230133 0.7988624 1.089973  O
43 
 -2.230133 0.7988624 1.089973  O
44 
 2.549699  2.9734976 0.6229589 H
44 
 2.549699  2.9734976 0.6229589 H
45 
 2.0527434 -1.736088 -1.493128 C
45 
 2.0527434 -1.736088 -1.493128 C
46 
 -2.480771 -2.726952 0.4882631 H
46 
 -2.480771 -2.726952 0.4882631 H
47 
 -3.008904 -1.902525 -1.049802 H
47 
 -3.008904 -1.902525 -1.049802 H
48 
 2.9176102 -1.848151 -0.785786 H
48 
 2.9176102 -1.848151 -0.785786 H
49 
 2.378786  -1.121191 -2.374365 H
49 
 2.378786  -1.121191 -2.374365 H
50 
 1.7189878 -2.748991 -1.843920 H
50 
 1.7189878 -2.748991 -1.843920 H
51 
 -0.151845 3.0970047 1.5348347 C
51 
 -0.151845 3.0970047 1.5348347 C
52 
 1.8934095 2.1181242 0.4193193 C
52 
 1.8934095 2.1181242 0.4193193 C
53 
 2.2861252 0.9968439 -0.244029 N
53 
 2.2861252 0.9968439 -0.244029 N
54 
 -0.168702 4.043655  0.9301094 H
54 
 -0.168702 4.043655  0.9301094 H
55 
 0.3535322 3.297906  2.5177748 H
55 
 0.3535322 3.297906  2.5177748 H
56 
 -1.207449 2.7537594 1.7203048 H
56 
 -1.207449 2.7537594 1.7203048 H
57 
 24 19  1
 57 
 24 19  1
58 
 22 19  1
 58 
 22 19  1
59 
 20 21  1
 59 
 20 21  1
60 
 20 12  1
 60 
 20 12  1
61 
 19 23  1
 61 
 19 23  1
Line 79... Line 79...
79 
  2 13  1
 79 
  2 13  1
80 
  2  7  1
 80 
  2  7  1
81 
  1 10  1
 81 
  1 10  1
82 
}
 82 
}
83 
 
 83 
 
84 
:La taille de l'applet, en pixels, largeur x hauteur.
 84 
:La mida de l'applet, en píxels, amplada x alçada.
85 
\text{size1=200x200}
 85 
\text{size1=200x200}
86 
 
 86 
 
87 
:Texte avant l'applet
 87 
:Text abans de l'applet
88 
\text{pre=Sélectionner tous les atomes}
 88 
\text{pre=Seleccionar tots els àtoms}
89 
 
 89 
 
90 
:Les atomes sur lequels il faut cliquer (une des lignes sera prise au hasard)
 90 
:Àtoms sobre els que fer clic (es triarà una de les línies aleatòriament)
91 
\matrix{atom=_N
 91 
\matrix{atom=_N
92 
_O
 92 
_O
93 
_C}
 93 
_C}
94 
 
 94 
 
95 
:Le texte de l'instruction spécifique à chaque ligne précédente
 95 
:El text de la instrucció específica de cada línia anterior
96 
\matrix{instruction=d'azote.
 96 
\matrix{instruction=de nitrogen.
97 
d'oxygène.
 97 
d'oxigen.
98 
de carbone.}
 98 
de carboni.}
99 
 
 99 
 
100 
:Texte après l'applet
 100 
:Text després de l'applet
101 
\text{post=<i>Vérifiez que le zoom de votre navigateur est sur la taille normale.</i>}
 101 
\text{post=<i>Comproveu que el zoom del navegador estigui a la mida normal.</i>}
102 
 
 102 
 
103 
:le script Jmol à effectuer lors de la présentation de l'exercice.
 103 
:la seqüència de comandaments Jmol a realitzar al presentar l'exercici.
104 
\text{scriptinput=select all;color atoms yellow; select none;}
 104 
\text{scriptinput=select all;color atoms yellow; select none;}
105 
 
 105 
 
106 
:le script Jmol à effectuer lors de la présentation de la réponse
 106 
:la seqüència de comandaments Jmol a realitzar al presentar la resposta
107 
\text{scriptoutput=}
 107 
\text{scriptoutput=}
108 
 
 108 
 
109 
 
 109 
 
110 
 
 110 
 
111 
:%%%%%%%%%%%%%% Rien à modifier avant l'énoncé %%%%%%%%%%%%%%%%
 111 
:%%%%%%%%%%%%%% Rien à modifier avant l'énoncé %%%%%%%%%%%%%%%%