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type=chemistry
textarea="data file atom scriptinput scriptoutput"

:Sélectionner certains atomes d'une molécule

On présente une molécule dans l'applet Jmol et on demande de sélectionner
certains atomes
<p>
Pour construire un exercice avec ce modèle, il suffit de donner le fichier
de structure et d'indiquer les atomes devant être sélectionnés.

<p>
Auteurs du modèle : Yves Noël et Bernadette Perrin-Riou <yves.noel@upmc.fr>

:%%%%%%%%%%%%%%%%%      ATTENTION      %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

Remove the above header if you destroy the model tags! (The lines starting
with a ':'.) Otherwise the exercise might not be taken back by Createxo.

:%%%%%%%% Sample parameters to be redefined %%%%%%%%%%%%%%%%%

:\title{Sélectionner dans l'espace}
:\author{Yves, Noël ; Bernadette, Perrin-Riou}
:\email{yves.noel@upmc.fr}
:\credits{}

:Fichier MDMol
\text{file=xxx
Jmol version 11.7.31  2009-03-28 16:42
EXTRACT: visible
 24 25  0  0  0
 -3.380413 -1.127236 0.5733036 H
 0.9668296 -1.073742 -0.819822 N
 0.0567293 0.8527195 0.3923156 C
 -1.375174 -1.021224 -0.057055 N
 -1.261501 0.2590713 0.5234135 C
 -0.306833 -1.683633 -0.716934 C
 1.1394234 0.1874122 -0.27009  C
 0.5602627 2.0839095 0.8251589 N
 -0.492679 -2.818055 -1.209473 O
 -2.632807 -1.730396 -0.006095 C
 -2.230133 0.7988624 1.089973  O
 2.549699  2.9734976 0.6229589 H
 2.0527434 -1.736088 -1.493128 C
 -2.480771 -2.726952 0.4882631 H
 -3.008904 -1.902525 -1.049802 H
 2.9176102 -1.848151 -0.785786 H
 2.378786  -1.121191 -2.374365 H
 1.7189878 -2.748991 -1.843920 H
 -0.151845 3.0970047 1.5348347 C
 1.8934095 2.1181242 0.4193193 C
 2.2861252 0.9968439 -0.244029 N
 -0.168702 4.043655  0.9301094 H
 0.3535322 3.297906  2.5177748 H
 -1.207449 2.7537594 1.7203048 H
 24 19  1
 22 19  1
 20 21  1
 20 12  1
 19 23  1
 19  8  1
 18 13  1
 15 10  1
 13 17  1
 13 16  1
 11  5  1
 10 14  1
 10  4  1
  9  6  1
  8 20  1
  7 21  1
  6  2  1
  5  3  1
  4  6  1
  4  5  1
  3  7  1
  3  8  1
  2 13  1
  2  7  1
  1 10  1
}

:La taille de l'applet, en pixels, largeur x hauteur.
\text{size1=200x200}

:Texte avant l'applet
\text{pre=Sélectionner tous les atomes}

:Les atomes sur lequels il faut cliquer (une des lignes sera prise au hasard)
\matrix{atom=_N
_O
_C}

:Le texte de l'instruction spécifique à chaque ligne précédente
\matrix{instruction=d'azote.
d'oxygène.
de carbone.}

:Texte après l'applet
\text{post=<i>Vérifiez que le zoom de votre navigateur est sur la taille normale.</i>}

:le script Jmol à effectuer lors de la présentation de l'exercice.
\text{scriptinput=select all;color atoms yellow; select none;}

:le script Jmol à effectuer lors de la présentation de la réponse
\text{scriptoutput=}



:%%%%%%%%%%%%%% Nothing to modify until statement %%%%%%%%%%%%%%%%

\text{cnt=\atom[;1]}
\integer{cnt=items(\cnt)}
\text{sel=randint(1..\cnt)}
\text{atom=\atom[\sel;]}
\statement{\pre \instruction[\sel;]
<p class="wimscenter">
\embed{reply 1, \size1

\scriptinput
\scriptoutput}
</p>
\post
}

:%%%%%%%%%%%%% Nothing to modify after. %%%%%%%%%%%%%%%%%5

\answer{}{\atom;\file}{type=jmolclick}